肉苁蓉主要有补肾阳、益精血、润肠通便的功效，中医常用于治疗肾阳不足、精血亏虚、肠燥便秘等症状。
1、补肾阳肉苁蓉归肾经，其温补特性有助于改善肾阳虚引起的腰膝酸软、畏寒肢冷、阳痿早泄等症状。肾阳虚可能导致生殖功能减退，肉苁蓉可与枸杞子、菟丝子等配伍增强疗效。
2、益精血肉苁蓉中苯乙醇苷类成分能促进造血功能，适用于精血不足导致的头晕目眩、须发早白、女性月经量少等。精血亏虚者长期服用时需配伍当归、熟地黄等滋阴药物以平衡药性。
3、润肠通便肉苁蓉含半乳糖醇和膳食纤维，能增加肠道润滑度，改善老年人或产后血虚引起的慢性便秘。使用时宜与火麻仁、杏仁等同用以加强润下作用，且更适合虚性便秘而非实热证。
4、延缓衰老肉苁蓉多糖和苯乙醇苷具有抗氧化活性，可清除自由基，减少细胞损伤，对改善皮肤老化、记忆力下降有一定帮助。常作为抗衰老配伍用药与黄芪、红景天等联合使用。
5、调节免疫肉苁蓉提取物能激活巨噬细胞和淋巴细胞，增强机体非特异性免疫应答，适合体质虚弱、易疲劳人群。免疫力低下者可在医生指导下配伍灵芝孢子粉协同调理。
肉苁蓉可煎汤或泡酒服用，建议每日用量6-15克，阴虚火旺及实热便秘者禁用。使用期间应避免辛辣刺激食物，注意作息规律，慢性病患者用药需经中医师辨证。长期服用者需定期评估体质变化，防止温补过度引发口干、上火等不良反应。