赤藓糖醇的副作用有影响口腔健康、过敏、消化道不适症状，建议患者适量食用，以免身体出现不适症状。
1、影响口腔健康赤藓糖醇通常会作为食品添加剂，加入口香糖、蛋糕等食品中，长期大量进食可能会出现龋齿、牙结石等口腔疾病，不利于口腔健康。
2、过敏部分患者使用赤藓糖醇后可能会出现皮肤发痒、呼吸急促等过敏症状，影响患者的正常生活。
3、消化道不适症状过量摄入赤藓糖醇可能会引起上腹部疼痛、腹泻等消化道不适症状。
除此之外，还可能会引起体重增加、肝脏损伤、危害血管健康等副作用，出现上述副作用，患者需及时停止食用赤藓糖醇，当症状得不到改善时，患者需要引起重视，到正规医院及时就诊，在医生指导下进行针对性治疗。