肌酸激酶同工酶是心肌损伤标志物，如果出现肌酸激酶同工酶增高，且患者有心肌缺血的症状，一般首先要考虑冠心病心肌梗死，这在中老年人群中相对比较常见，在年轻人群中则需要考虑心肌炎导致的心肌细胞坏死引起的同工酶增高。
但是并不是所有的同工酶增高都提示冠心病或者是心肌炎，还有一些中毒性心肌病、应激性心肌病、糖尿病心肌病等，也可以引起肌酸激酶同工酶增高，特别是糖尿病合并酮症酸中毒或者乳酸中毒时，也可以出现同工酶增高，此外，一些恶性肿瘤、心包炎等或者慢性肾脏功能衰竭，都有可能会引起肌酸激酶同工酶增高。并且有时横纹肌损伤或溶解也可能会肌酸激酶同工酶增高，这是就应该看肌酸激酶本身的水平及查肌钙蛋白，来进行鉴别，排除心肌受损的情况。