现在没有专门生产针对新生儿的眼药水。 目前，应用于儿童、儿童和新生儿的眼药水是成人制剂，按医生的指示可以给新生儿使用。 新生儿或儿童通常使用的眼药水有托百士眼药水、可乐必妥眼药水等，最新生产的是盐酸莫西沙眼药水，这些眼药水在临床经验上抗炎效果较好，且没有明显的副作用。 在临床药理学研究中，像妥布霉素这样的长期应用可能会引起耳聋，而莫西沙星和左氧氟沙星则有抑制软骨发育的作用，而在临床研究中，短期局部应用全身吸收少，基本上发生这种副作用的概率非常低，可以给新生儿和儿童短期局部使用。
新生儿滴眼液的注意事项
父母把新生儿稍微仰起，在头上的方向用玩具吸引他，让眼睛朝头上的方向看，打开下眼睑，把眼药水滴到下眼皮内。 使用眼药水时，滴下后，需要闭上眼睛1~2分钟，睁开眼睛后用手帕擦拭眼睛周围的药液。 眼药膏的话，点完后闭上眼睛用手帕轻轻擦拭，使眼药膏能扩散到整个眼睛。 眼药水与眼药膏并用时，必须先滴入眼药水，再点眼药膏。
点眼药的时候，要注意不要离眼睛太近，防止扎到眼睛，要加快动作。 新生儿得眼病的时候，眼屎很多，所以上眼药的时候先把眼屎擦干净。 眼屎沾到眼睛上就睁不开，所以用消毒棉球用温水弄湿，在眼睛上涂一会儿，然后从眼角轻轻地向外侧擦。 注意不要往返。 一个棉球只擦一只眼，擦干净后再点眼药。 对于不配合的孩子，可以在睡觉后上眼药。