益生元好还是益生菌好通常情况下并没有一定的比较性，对身体都能够起到保养的作用，可以根据自身的需求来选择。益生元是属于膳食补充剂，可以起到促进肠胃道蠕动的作用，对于肠胃道内容物的吸收能够起到促进的作用，可以帮助消化不良症状得到改善，而且也可以帮助便秘的症状得到改善，同时能够降低肠道感染炎症的发生概率。益生菌当中的主要成分是有益菌，在吃了以后能够维持肠道内的菌群平衡，多以肠道内菌群失衡能够起到调理的作用，可以帮助胃肠道胀痛以及恶心或者呕吐的症状得到改善，所以这两种药物之间的功效并没有比较性。
益生菌或者是益生元，都需要在医生的指导下服用，一般需要根据病情的轻重程度决定用药剂量，通常情况下并不可以盲目的用药，过量的用药以后可能会导致肠道内有益菌紊乱，并且会导致肠胃道的吸收和消化能力受到影响。在用药的过程中需要控制饮食，要避免吃海鲜类的食物或者油腻性的食物，否则会导致益生菌的补充效果受到影响，多吃一些清淡的饮食。