严重弱畸形精子症可以通过一般治疗、药物治疗、手术治疗、辅助生殖技术、人工授精等方式进行治疗，需要根据引起的病因进行对应的治疗。
1、一般治疗
患者在日常生活中，要保持良好的生活习惯，避免吸烟喝酒，还要避免熬夜，保证充足的睡眠时间，避免过度劳累。饮食方面也要改善，多吃一些营养物质丰富的食物，少吃辛辣刺激油腻的食物。
2、药物治疗
患者可以在医生的指导下服用生精胶囊、五子衍宗丸等药物进行治疗，能够起到补肾益精的功效，有利于改善病情。如果伴有炎症，也可以遵医嘱服用抗生素类的药物进行治疗，比如盐酸左氧氟沙星胶囊、阿莫西林胶囊等，能够起到消炎杀菌的效果。
3、手术治疗
如果患者病情比较严重，出现了精索静脉曲张的情况，可以通过精索静脉曲张高位结扎术等相关的手术进行治疗，从而达到治疗的目的。
4、辅助生殖技术
如果患者通过上述治疗无法改善，也可以通过辅助生殖技术进行治疗，如人工授精、试管婴儿等。
5、人工授精
对于病情严重的弱畸形精子症患者，可通过人工授精的方式，将健康的精子取出，在体外进行优选，然后将其与卵子结合，形成受精卵，在医生指导下进行胚胎移植，以此达到怀孕的目的。
日常生活中，患者要保持良好的心情，避免情绪过于激动，还要避免频繁进行性生活。如果患者出现不适症状，建议及时就医治疗。
本内容不能代替面诊，如有不适请尽快就医。